İdrar yolu enfeksiyonu takip edilmeli ve daha da önemlisi tedavi edilmelidir. İdrar yolu enfeksiyonu tedavi edilmediğinde pelvik taban kaslarının doğru zamanda kasılıp doğru zamanda gevşeyerek uyum içinde çalışan yapısını bozmaktadır. Buna bağlı olarak mesane içinde kalan idrar miktarındaki artış ve işeme sırasındaki yüksek basınç mesanenin yapısını etkileyerek mesane iç yapısında bozulmalara neden olmaktadır. Bu durumda birbirini takip eden bir takım alt üriner sistem semptomlarının ortaya çıkmasına neden olarak mesane ve böbrek fonksiyonlarında ciddi problemlerin oluşmasına neden olabilir. Mesanede işeme sonrası kalan idrar, böbreklere geri kaçabilir ve böbreklere geri kaçan idrar böbreklerde kalıcı hasar meydana getirebilir. Bu hasar da zamanla böbrek yetmezliğine neden oluşturarak hayati problemlerin oluşmasına zemin hazırlayabilir. O nedenle İYE’ nin tedavisi ertelenmeden veya ihmal edilmeden en kısa süre içerisinde başlanmalıdır.
Bunların yanı sıra sürekli idrar kaçırma çocuğun sosyalleşmesini ve düzenli okula gidebilmesini engelleyerek okul başarısını etkiler. Çocukta ciddi psikolojik bozukluklara ve özgüven eksikliğine de sebep oluşturur.